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Il complesso della chiesa con il monastero che porta lo stesso nome si trova sul lato nord-ovest della piazza Kaptol, nella zona in cui il mercato si restringe e diventa la strada che porta più a nord. La chiesa di proporzioni monumentali è stata costruita nel Duecento ma è possibile che i francescani già da prima avevano la loro residenza li. La struttura gotica nell'interno della sala parrocchiale di grandi dimensioni con il lungo coro ed il santuario allungato non è sostanzialmente cambiata e nel senso spaziale viene considerata uno dei più maturi edifici religiosi francescani dell'Europa centrale.  Ha la volta in forma di croce e costola. La cappella di San Francesco è decorata dai cartigli dipinti che rappresentano la vita del santo e motivi floreali e di angeli. Il ciclo del inizio di barocco con un tocco di manierismo è stato costruito intorno al 1683. La chiesa ed il convento sono stati completamente rinnovati dopo il terremoto del 1880, quando si cercava di ottenere il carattere gotico originale dell'edificio. La chiesa ha avuto una nuova torre campanaria con un tetto spiovente. Durante la ristrutturazione, dalla parte di Kaptol è stata aperta la cappella di Gesù Crocifisso. Sul lato sud del monastero, tra Kaptol e Opatovina, nel 1936 ebbe inizio la costruzione della cosiddetta sala francescana, oggi teatro Komedija. In chiesa, sull'altare principale neogotico si trova il quadro di San Francesco del pittore Celestin Medović. Vetrate nell'abside con motivi ispirati dai fiori di San Francesco sono lavoro dell'artista Ivo Dulčić dal 1960.